MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 63725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	AT	3	6	15	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004603	TA	4	8	27	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004603	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004603	CGA	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004603	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004603	TCT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004603	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004603	T	6	6	276	281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004603	T	6	6	297	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004603	GCA	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896775
11	NC_004603	TCT	2	6	414	419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896775
12	NC_004603	ATCA	2	8	440	447	50 %	25 %	0 %	25 %	28896775
13	NC_004603	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896775
14	NC_004603	TGC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896775
15	NC_004603	GTGG	2	8	641	648	0 %	25 %	75 %	0 %	28896775
16	NC_004603	GGTT	2	8	696	703	0 %	50 %	50 %	0 %	28896775
17	NC_004603	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896775
18	NC_004603	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896775
19	NC_004603	CTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004603	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896776
21	NC_004603	GAAGA	2	10	929	938	60 %	0 %	40 %	0 %	28896776
22	NC_004603	GTC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896776
23	NC_004603	TGC	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896776
24	NC_004603	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896776
25	NC_004603	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896776
26	NC_004603	GC	3	6	1108	1113	0 %	0 %	50 %	50 %	28896776
27	NC_004603	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896776
28	NC_004603	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896776
29	NC_004603	GTCG	2	8	1348	1355	0 %	25 %	50 %	25 %	28896776
30	NC_004603	CCA	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896776
31	NC_004603	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	28896776
32	NC_004603	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896776
33	NC_004603	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896776
34	NC_004603	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896776
35	NC_004603	GCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896776
36	NC_004603	GAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896776
37	NC_004603	ACT	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896776
38	NC_004603	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896776
39	NC_004603	GAT	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896776
40	NC_004603	TCT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896776
41	NC_004603	GGC	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896776
42	NC_004603	CCA	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896776
43	NC_004603	GA	3	6	1815	1820	50 %	0 %	50 %	0 %	28896776
44	NC_004603	TGC	2	6	1852	1857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896776
45	NC_004603	TTC	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896776
46	NC_004603	ATCA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	28896776
47	NC_004603	GCT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896776
48	NC_004603	TTGG	2	8	2182	2189	0 %	50 %	50 %	0 %	28896776
49	NC_004603	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896776
50	NC_004603	ACC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896776
51	NC_004603	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004603	CAAAAA	2	12	2336	2347	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_004603	GCC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_004603	GT	3	6	2396	2401	0 %	50 %	50 %	0 %	28896777
55	NC_004603	T	6	6	2407	2412	0 %	100 %	0 %	0 %	28896777
56	NC_004603	ACCA	2	8	2465	2472	50 %	0 %	0 %	50 %	28896777
57	NC_004603	GAA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896777
58	NC_004603	AAG	4	12	2501	2512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896777
59	NC_004603	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896777
60	NC_004603	GTT	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896777
61	NC_004603	TCT	2	6	2580	2585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896777
62	NC_004603	AGT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896777
63	NC_004603	GTA	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896777
64	NC_004603	GAA	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896777
65	NC_004603	CTTTCT	2	12	2772	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896777
66	NC_004603	CAT	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896777
67	NC_004603	GTC	2	6	2821	2826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896777
68	NC_004603	CAC	2	6	2919	2924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896777
69	NC_004603	GAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896777
70	NC_004603	CGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896777
71	NC_004603	AGCA	2	8	2986	2993	50 %	0 %	25 %	25 %	28896777
72	NC_004603	GTGA	2	8	2994	3001	25 %	25 %	50 %	0 %	28896777
73	NC_004603	AGCC	2	8	3023	3030	25 %	0 %	25 %	50 %	28896777
74	NC_004603	ACT	2	6	3038	3043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896777
75	NC_004603	CTG	2	6	3063	3068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896777
76	NC_004603	TTG	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896777
77	NC_004603	TACG	2	8	3153	3160	25 %	25 %	25 %	25 %	28896777
78	NC_004603	AGC	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896777
79	NC_004603	AGT	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896777
80	NC_004603	TGC	2	6	3256	3261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896777
81	NC_004603	T	6	6	3325	3330	0 %	100 %	0 %	0 %	28896777
82	NC_004603	ACC	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896777
83	NC_004603	GTT	2	6	3442	3447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896777
84	NC_004603	GTT	2	6	3454	3459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896777
85	NC_004603	GCT	2	6	3625	3630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896777
86	NC_004603	CAA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896777
87	NC_004603	TGA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896777
88	NC_004603	TG	3	6	3686	3691	0 %	50 %	50 %	0 %	28896777
89	NC_004603	TGA	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896777
90	NC_004603	CAG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896777
91	NC_004603	CCA	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896777
92	NC_004603	TCGA	2	8	3779	3786	25 %	25 %	25 %	25 %	28896777
93	NC_004603	TCA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896777
94	NC_004603	CTG	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896777
95	NC_004603	TTGA	2	8	3894	3901	25 %	50 %	25 %	0 %	28896777
96	NC_004603	TTG	2	6	3946	3951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896777
97	NC_004603	AAGA	2	8	3959	3966	75 %	0 %	25 %	0 %	28896777
98	NC_004603	GTTA	2	8	4013	4020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004603	TGG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004603	C	6	6	4059	4064	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_004603	TTCA	2	8	4065	4072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004603	GATAAA	2	12	4214	4225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004603	AAC	2	6	4281	4286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896778
104	NC_004603	GC	3	6	4315	4320	0 %	0 %	50 %	50 %	28896778
105	NC_004603	TTC	2	6	4323	4328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896778
106	NC_004603	CAA	2	6	4336	4341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896778
107	NC_004603	TTTG	2	8	4346	4353	0 %	75 %	25 %	0 %	28896778
108	NC_004603	CGAC	2	8	4410	4417	25 %	0 %	25 %	50 %	28896778
109	NC_004603	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896778
110	NC_004603	ATT	2	6	4607	4612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896779
111	NC_004603	GC	3	6	4620	4625	0 %	0 %	50 %	50 %	28896779
112	NC_004603	ACG	2	6	4638	4643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896779
113	NC_004603	AGT	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004603	AAG	2	6	4814	4819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004603	TA	3	6	4825	4830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004603	GAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004603	CAA	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_004603	CCGG	2	8	4918	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_004603	T	6	6	5011	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	28896780
120	NC_004603	CGA	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896780
121	NC_004603	CTT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896780
122	NC_004603	GT	3	6	5131	5136	0 %	50 %	50 %	0 %	28896780
123	NC_004603	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896780
124	NC_004603	CTT	2	6	5170	5175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896780
125	NC_004603	GA	3	6	5183	5188	50 %	0 %	50 %	0 %	28896780
126	NC_004603	TCA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896780
127	NC_004603	GCT	3	9	5283	5291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896780
128	NC_004603	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896780
129	NC_004603	ATC	2	6	5344	5349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896780
130	NC_004603	CTG	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896780
131	NC_004603	TTC	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896780
132	NC_004603	CACG	2	8	5394	5401	25 %	0 %	25 %	50 %	28896780
133	NC_004603	AAAC	2	8	5466	5473	75 %	0 %	0 %	25 %	28896780
134	NC_004603	GTC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896780
135	NC_004603	TCG	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896780
136	NC_004603	GAT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896780
137	NC_004603	ATC	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896780
138	NC_004603	GTAC	2	8	5723	5730	25 %	25 %	25 %	25 %	28896781
139	NC_004603	AGT	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896781
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272	NC_004603	GCA	2	6	12487	12492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896788
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274	NC_004603	GC	3	6	12542	12547	0 %	0 %	50 %	50 %	28896788
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278	NC_004603	TGT	2	6	12737	12742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896788
279	NC_004603	AAG	2	6	12749	12754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896788
280	NC_004603	TTA	2	6	12764	12769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896788
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305	NC_004603	TGG	2	6	13827	13832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_004603	GTCA	2	8	18530	18537	25 %	25 %	25 %	25 %	28896794
400	NC_004603	CGTTG	2	10	18551	18560	0 %	40 %	40 %	20 %	28896794
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